Kemitraan Messi yang kuat dengan rekan satu timnya juga terlihat saat bermain untuk timnas Argentina. Salah satunya adalah kemitraannya dengan Gonzalo Higuain yang sering menjadi pilihan utama Messi di lini depan. Mereka saling melengkapi dalam berbagai turnamen, termasuk saat mereka mencapai final Piala Dunia 2014 dan Copa America 2015 dan 2016.
Messi juga memiliki kemitraan yang kuat dengan Sergio Aguero, rekannya di timnas Argentina. Kedua pemain memiliki hubungan persahabatan yang dekat, dan ketika bermain bersama-sama, mereka sering menciptakan peluang yang berbahaya dan gol yang penting.***